乔安妮·伯吉斯的研究重点是环境和自然资源在可持续经济发展中的作用，特别是在发展中国家。她对森林土地利用、野生动物管理和环境风险管理特别感兴趣。她研究了国际贸易在自然资源利用和环境管理方面的作用，包括野生动物和森林产品的贸易。她的研究兴趣还包括设计促进可持续经济发展的政策，特别是考虑到气候变化、林地转换和生物多样性丧失等重大的全球环境挑战。